扬州大学长江文化研究院成立于2022年3月，是扬州大学实体性智库研究机构，2023年4月入选江苏省重点培育智库。

研究院成立以来，始终围绕习近平总书记关于“要把长江文化保护好、传承好、弘扬好”这一重大决策部署，按照习近平总书记关于长江文化传承保护系列指示、批示精神，整合校内外研究资源，开展相关学术研究和智库服务，取得了一批重要成果，获得了较大的社会反响。研究院以建设全国有影响力的高端智库为目标，通过实施“六个一”工程（1支高水平研究决策咨询队伍、1个长江文化学术论坛、1本辑刊《长江文化学刊》、1本内参《长江文化智库专报》、1个长江文化数据库、1个长江文化传播教育基地），打造融“学术、咨询、传播、数据库“四位一体”的长江文化研究高端智库。通过进一步优化内外部发展环境和体制机制，使研究院成为服务长江文化传承保护和地方经济社会发展的一支重要智库力量。

中国大运河研究院成立于2017年3月，2025年7月起挂靠长江文化研究院的研究基地。研究院成立以来，在上级单位的指导支持下，在学校党委、行政的直接领导下，研究院围绕大运河文化带、大运河国家文化公园建设等国省市战略部署，积极开展学术研究、决策咨询和社会服务工作，取得了一系列重要成果，产生了广泛的社会影响。